DNR "akys" gali nuslepti vezio genus

Nors genu skaitymo technologija yra pazangi ir sudetinga, yra tam tikru DNR daliu, su kuriomis jos puikiai nesijaudina; Pavyzdziui, yra pasikartojanciu DNR sriciu, del kuriu masinos "uzstringa". Taciau yra budas isnagrineti sias "aklas vietas" ir suzinoti, ar jie slepia vezio genus.
Tyrejai panaudojo dvi dideles vezio genu duomenu bazes, kad butu galima nustatyti Akliu tasku DNR, kuriuose gali buti vezi sukelianciu genu.

Tai buvo naujojo Jungtines Karalystes Mancesterio universiteto mokslininku, dirbanciu "Cancer Research UK", tyrimo isvados zurnale Vezio tyrimai.

Grupe nustate, kad daugiau nei 400 DNR speneliu, galinciu uzkirsti kelia vezi sukelianciu genu sutrikimu, buvo daugiau kaip 400 netikriu spuogu, teige "The Cancer Research UK Manchester Institute" mokslinis tyrejas Andrewas Hudsonas:

"Veziu uzkreciantys genai yra kaip istorija. Nors mes galejome skaityti daugeli knygu naudodamiesi genu skaitymo technologija, siu priemoniu ribos reiskia, kad truksta kai kuriu puslapiu".

"Sie puslapiai gali buti tik nesvarbus uzpildai, - priduria jis, - bet mes idomu, ar jie gali tureti reiksmingu poslinkiu, galinciu paveikti musu supratima apie vezi. Kitas musu darbo zingsnis - rasti buda atidaryti siuos sritys, padedancios suskaidyti visa istorija ".

Komanda palygino dvi dideles vezio genu duomenu bazes

Noredami ieskoti "trukstamu puslapiu", komanda palygino dvi reiksmingas vezio genomo sekos duomenu bazes, kurios gavo savo informacija is labdaringu vezio lasteliu tyrimu, ir patikrino visus genus, kurie yra zinomi ar itariami susije su veziu, kad butu galima rasti bet kokie neatitikimai.

Dvi ju naudojamos duomenu bazes yra CCLE, "Cancer Cell Line Enciklopedija" ir "COSMIC", Katalogas somatiniu mutaciju veziu.

Jie raso, kaip ju analize "atskleide pastebetus neatitikimus identifikuojant missetu mutacijas vienodose lasteliu linijose (57,38 proc. Atitikties)", ir jie pastebi, kad pagrindine neatitikimo priezastis yra "netinkama GC turtingu sriciu seka".

Kitaip tariant, kai kuriuose DNR regionuose dvieju duomenu baziu kodu sekoje buvo daugiau kaip 40% neatitikimu, nors informacija buvo pateikta is vienodu lasteliu liniju. Autoriai atkreipia demesi i sias neatitikimus DNR sriciu "GC" turtingose ??srityse. GC reiskia guanina ir citozina, du is keturiu DNR sudedamuju daliu.

Be to, kaip "principo irodymas", rodantis, kad verta daugiau demesio skirti naujiems veziu sukeliantiems vairuotojams akliose vietose, komanda sutelke demesi i naujai nustatytas PAK4 geno mutacijas. Jie parode, kad "konkreciu tikslumo ir sekos nustatymas" turtingu GC akluju tasku "gali lemti nauju vairuotoju mutaciju identifikavima zinomuose naviku slopintuvuose ir onkogenuose".

Jie daro isvada, kad ju tyrimas rodo kryzmini nuoroda tarp dazniausiai naudojamu lasteliu liniju genu duomenu baziu, galima aptikti nauju vezio varomuju jegu - zvelgiant i blogai sekvencines sritis.

"Gilesne i vezio genetine kilme", norint rasti ligos priezastis

Nell Barrie, vyresnysis mokslinis informacijos vadybininkas "Cancer Research UK" teigia:

"Gilinant i vezio genetine kilme, galime pastebeti ligos atsiradimo ir vystymosi budus. Tai galetu mums padeti isspresti sia problema is saknies, suteikiant daugiau veziu sergantiems pacientams galimybe isgyventi liga".

2014 m. Spalio men. Medicinos naujienos siandien ismoko, kaip suprasti, kaip lasteles kopijavimo chromosomas gali buti svarbu kovojant su veziu. Mokslininku komanda atrado, ar DNR grandiniu atsukimo komponentas lieka nepakites po to, kai chromosomu kopijavimas yra baigtas, jis gali pazeisti lasteliu dalijima, kuris yra zinomas del vezio.