Mokslininkai sutriuskino "didelius duomenis", kad butu sukurtas naujas veziu vairuotoju genu katalogas

Siekdami tobulinti musu supratima apie vezi ir tobulinti gydymo budus, mokslininkai gauna daugybe genetiniu duomenu, kuriuos dabar galima identifikuoti - nuo genu, kurie budingi veziui, - tam tikra pogrupi, kuris skatina naviko progresavima. Dabar naujas tyrimas rodo, kaip viena grupe nustate daugiau kaip 100 nauju tokiu vezio vairuotoju.
Viena is baltymu sasaju, kuria nustate mokslininkai, buvo sis zinomas vezio genas, EGFR. Raudoni lopai akcentuoja mutacijas, kurios sunaikina baltymu ir baltymu sasaja.
Vaizdo kreditas: Godzik / SBP

Tyrimas, vadovaujamas Sanford Burnham Prebys medicinos atradimu instituto (SBP), La Jolla, CA, yra paskelbtas zurnale PLOS skaiciavimo biologija.

Kiekviena vezio rusis yra susijusi su daugybe genu mutaciju, is kuriu tik is dalies yra is tikruju atsakinga uz naviku vairavima.

Dabar augantis vezio tyrimu srities elementas yra sijojimas per daugybe duomenu, gautu atliekant didelio masto naviku sekos tyrimus, siekiant atskirti "keleiviu" mutacijas nuo "vairuotojo" mutaciju, siekiant padidinti musu supratima apie vezi ir tobulinti gydyma liga.

Siame lauke yra nepakankamai suprantama sritis, o genu mutaciju vaidmuo vadinamuosiuose "baltymu ir baltymu saveikos" (PPI) sasajose, kaip veziniu veiksniu, vaidmuo.

Baltymai yra svarbios molekules, kurios atlieka ivairius procesus viduje ir tarp lasteliu, daugiausia jungdamos juos su kitais baltymais. Baltymu saveikos budas - ju PPI sasajos - laikomos gyvybiskai svarbia funkcija, ir viskas, del kurios jie sugenda, pvz., Genu mutacijos, gali sukelti tokias ligas kaip vezys.

Naujo tyrimo metu grupe naudojo vezio mutaciju ir baltymu strukturos duomenu bazes, kad nustatytu pacientu naviku, kurie keicia iprastas PPI sasajas, mutacijas.

Svinas autorius Eduard Porta-Pardo, SBP postdoktorius sako, kad ju tyrimas yra pirmasis, naudojantis erdviniu baltymu savybes, tokias kaip PPI, siekiant nustatyti vairuotojo genus dideliu vezio duomenu rinkiniu. Jis apibendrina isvadas:

"Mes nustateme 71 sasajas baltymuose, anksciau nepripazintus kaip veziniu veiksniu, atstovaujanciu potencialiems naujiems vezio numatomiems zymeklams ir (arba) vaistu tikslams. Musu analize taip pat nustate keleta vairuotojo sasaju zinomuose vezio genuose, tokiuose kaip TP53, HRAS, PI3KCA ir EGFR, ir tai patvirtina, kad musu metodas gali rasti atitinkamus veziu vairuotojo genus ir kad baltymu sasaju pokyciai yra bendras patogeninis vezio mechanizmas. "

PPI sasaju, praturtintu vezio mutacijomis, pokyciai

Noredami sugadinti duomenis, mokslininkai naudojo isplestine "e-Driver" versija - algoritma, sukurta SBP baltymu regionams, kurie skatina vezi.

Si grupe surinko duomenis apie beveik 6000 pacientu is "The Cancer Genome Atlas" ir daugiau kaip 18 000 triju matmenu baltymu strukturu is Baltymu duomenu banko.

Autoriai teigia, kad tyrimas rodo, kad "vertinant baltymus kaip daugiafunkcines gamyklas, o ne monolitines juodas dezes", galima nustatyti naujus veziu vairuotojo genus ir pasiulyti molekulinius paaiskinimus, kodel pacientai, turintys tuos pacius vairuotojo genus, gali tureti skirtingus rezultatus arba reaguoti skirtingai i gydyma .

Vyresnysis autorius Dr. Adam Godzik, SBP Bioinformatikos ir strukturines biologijos programos direktorius, paaiskina, kaip jie naudojo "e-Driver", kad apdorotu didziuli duomenu rinkini:

"Sis algoritmas analizuoja, ar PPI sasaju strukturos pokyciai yra praturteti vezio molekulese, todel gali nustatyti kandidaciu vairuotojo genus."

Jis daro isvada:

"Idomu tai, kad nustateme kai kuriuos galimus veziniu veiksniu, kurie dalyvauja imunineje sistemoje. Didejant imunines sistemos svarbai vezio progresavimui, imuniteto genai, kuriuos mes nustateme siame tyrime, suteikia naujos informacijos apie tai, kokia saveika gali buti labiausiai paveikta "

Atsizvelgiant i ju dydi, drambliai turetu buti labai jautrus veziui, taciau jie retai vysto liga. Medicinos naujienos siandien neseniai pranese apie Jetos medicinos mokyklos vadovaujama studija, kurioje pateikiami keli nauji patarimai del drambliu atsparumo veziui mechanizmu. Rastu JAMA, mokslininkai teigia, kad si informacija taip pat gali apzvelgti zmogaus atsparuma veziui.

Sesi isialgijai tesiasi skausmo malsinimas

Turinys Apzvalga Issipletimai skausmo malsinimui Gydymas Priezastys Prevencija Sindiala nera salyga, bet labai nemalonus daugelio galimu problemu nugaroje, dubens ir klubo srityje simptomas. Zmones su isialgija daznai patiria skausma pro sedmenis ir apatine kojos dali.

(Health)

Nauja kruties vezio plitimo i smegenis strategija

Pasak JAV mokslininku, dvieju pirminiu piktybiniu smegenu naviku gydymo klinikiniu tyrimu metu dvieju nauju gydymo budu derinys taip pat gali buti veiksmingas kruties vezio, kuris paplito i smegenis, gydymui. Kalifornijos Los Andzelo universiteto komanda istyre savo nauja metoda, kuris jungia imunoterapija su genu terapija pelems.

(Health)