Dvilyje sekmingos technologijos naudojant puslaidininkius, sukurtus - mazos sanaudos, nesiojamosios ir keiciamos

"Ion Torrent Systems Inc." mokslininkai sukure DNR sekos nustatymo metodika, naudodami puslaidininkius, o ne brangus ir sudetingas optines technologijas. Jie sako, kad ju irenginys yra daug mazesnis, jis yra nesiojamas ir gali buti atnaujintas (keiciamas). Ju tikslas yra pasiekti tiksline 1000 $ uz genomo sekos nustatymo kaina.
Kompanijos ikurejas dr. Jonathanas Rothbergas, masinos isradejas ir komanda zurnale Gamta sia savaite:

"Svarbiausia DNR sekos nustatymas i gyvosios gamtos mokslus, biotechnologijas ir medicina paskatino ieskoti labiau pritaikomu ir pigiu sprendimu".

Kompanija teigia, kad ju irenginys turi platu DNR sekos diapazona, nuo mikrobu iki zmoniu.
Irenginys, kuri bendrove nurodo kaip PGM (asmeninio genomo masina), naudoja daugybe lygiagreciu puslaidininkiu jutikliu, kurie matuoja DNR replikacijos metu susidariusius vandenilio jonus. Tai atliekama realiuoju laiku. Paprasciau tariant, masina turi silicio mikroschema, kurioje yra 1,2 milijono jutikliu, sudarytu is mazu suliniu. Jie yra uzpildyti granulemis, kuriose yra sekvenciniu DNR grandiniu. Gaubte yra detektoriai, kurie matuoja vandenilio jonus, kurie susidaro DNR replikacijos metu. DNR sekos nustatymas gali buti uzbaigtas per mazdaug dvi valandas, o ne savaites.
"Ion Torrent Systems" viceprezidentas rinkodaros ir verslo pletros, Maneesh Jain, sake, kad E. coli per pastaruosius protrukius Vokietijoje ir Kinijoje buvo nustatytos per pirmas tris dienas, naudojant PGM, o ne keleta savaiciu. Tai suteike sveikatos institucijoms brangesni laika ka nors padaryti.
Jain pridure, kad bendroves PGM naudojama laboratorijose visame pasaulyje daugiau nei 40 saliu.
Dr. Jonathanas Rothbergas sako, kad ju masina buvo naudojama "Intel", Gordono Mooreo ikurejo genomui issifruoti.
Dr. Rothbergas sake:

"Gordonas Moore sukure visus gudrybes, suteikiancius mums siuolaikinius puslaidininkius, todel jis turetu buti pirmasis asmuo, kuris turi buti sekvenuotas puslaidininkiuose."

DNR kodavimo irenginys parduoda 49 000 JAV doleriu, gerokai maziau nei jo dabartiniai konkurentai.
Keletas kompaniju konkuruoja, kad pasiektu 1000 JAV doleriu kainu zetona zmogaus genomo sekos nustatymui, nes, pasak ekspertu skaiciaus, jie galetu sudaryti salygas iprastinei medicinos praktikai atlikti. "Ion Torrent Systems" mano, kad iki 2013 m. Jos pasiekia 1000 JAV doleriu.

Mokslininkai parase Gamta kad:

"(Dr. Moore genomo genetinis variantas nurodo a) 56% tikimybe, kad rudos akys ... tipiskas frekklingumas ... yra siek tiek didesnis sparagu kvapo tikimybe slapime".

Autoriai pridure, kad, stebetinai, Dr. Moore genomas reiskia didesne psichines atsilikimo rizika. Akivaizdu, kad zmogus pasirode esas labai protingas, todel idomu, kaip naudingi sie genomo duomenys.
Dr. Rothbergas pabreze, kad esame bent desimt metu nuo tinkamo zmogaus genomo supratimo; tokiu budu, kuris galetu buti tikrai naudingas. Taciau naujas prietaisas yra naudingas, kai daugiausia demesio skiriama genu atrankai, kaip gali buti ir tiriant vezi.
DNR seka yra tiksli baziu sudarymas - A (adeninas), T (timinas), G (guaninas), C (citozinas) - DNR molekuleje. DNR sekos nustatymas reiskia identifikuoti tikslia baziniu poru tvarka DNR segmente.
"Integruotas puslaidininkinis itaisas, igalinantis neoptinio genomo sekvenavima"
Jonathan M. Rothberg, Wolfgang Hinz, Todd M. Rearick, Jonathan Schultz, William Mileski, Mel Davey, John H. Leamon, Kim Johnson, Mark J. Milgrew, Matthew Edwards, Jeremy Hoon, Jan F. Simons, David Marran, Jason W. Myers, John F. Davidson, Annika Branting, John R. Nobile, Bernard P. Puc, David Light, Travis A. Clark, Martin Huber, Jeffrey T. Branciforte, Isaac B. Stoner, Simon E. Cawley, Michael Lyons et al.
Gamta 475, 348-352 (2011 m. Liepos 21 d.) Doi: 10.1038 / nature10242
Parase Christian Nordqvist